『ヱヴァンゲリヲン新劇場版:序』

突如世界を襲った未曾有の大災害“セカンド・インパクト”。

この影響で人類の半数近くは死にいたり、世界の各地には大破壊の痕跡が刻みこまれた。

やっと平穏な日々が戻ったと思われたとき--14歳の少年・碇シンジは父親から第3新東京市へ呼び出されて、出迎えを待っていた。

世界の命運を託された14歳の少年シンジは、はたしてどう戦うのか？

そして、セカンド・インパクトに隠されたキーワード「人類補完計画」の真実とは？

すべての謎の鍵を握る碇ゲンドウは、シンジの苦闘をじっと見つめている……。