『ひまわりっ!!』

日本のどこかの風情ある片田舎。

霞高原町、通称“霞の里”実はこの里には、ある養成学校がある･･･それはなんと「くノ一」養成学校・“私立志能備学園”!!

忍者に憧れ、学園に転校してきた、ふつーの女の子・日向ひまわり。

なんやかんやと、てんやわんやな学園生活ではあったが、ご主人様と慕ってきた志能備学園の教師・万里小路ハヤトと、主従の契りを永遠に約束し、ちょっとはくノ一らしくなれたかな？

というのが前回までのお話。

ひまわりとハヤト、くノ一候補生・あざみ、しきみ、ヒメジ、ゆすら達は相変わらずドタバタと平和な修行の日々をおくっていた。

だが、志能備学園に、謎の組織の魔の手がひっそりと忍び寄る・・・。

志能備学園男子校が突然、爆破され、男子生徒が忽然と消え去る事件が起こる!

なにやら陰謀の匂いが漂う中、それを平然と、男子校の取り潰しだと言い張る学園側。

学園側の言い分に釈然としないひまわり達に、矢継ぎ早に謎の組織・異能の忍者達が襲いかかる!!

これってもしかして“霞の里”と、“志能備学園”の存亡の危機!？

ひまわりとハヤトの運命は如何に!？

それでも、ご主人様をお守りしますっ!