『映画 妖怪ウォッチ 空飛ぶクジラとダブル世界の大冒険だニャン！』

ケータたちが暮らすさくらニュータウンに、空飛ぶ巨大クジラが出現。

クジラの発した大きな声と共に、ケータや妖怪たちは実写の世界へやって来てしまう。

髪を引っ張ってみると痛みを感じ、手にはしわ、さらには肌には毛穴まで見え、ジバニャンたちも困惑する。

ケータたちはアニメと実写の世界を行き来しながら、その原因を探ろうと奔走する。