被巴古拉兽击回到人类世界的工藤大器和高吼兽,经过东京大决战留在人类世界一天后,相对地数码世界已经过了好几个月的时间,并落入了巴古拉军支配下的地狱世界,分裂为七个国家(Land),由七名巴古拉军手下的死亡指挥官所统治,而这七名死亡指挥官就是本篇章的主要敌人。
为了让数码世界再次得到和平,工藤大器和高吼兽决定再次回到危机四伏的数码世界中。
此外,本篇章亦出现全新力量“超进化”。
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