現代のネットワーク社会の発展と共に生まれた仮想空間「デジタルワールド」。
そこではデジタル生命体である「デジタルモンスター」が誕生し、ホストコンピュータ「イグドラシル」が世界の全てを管理していた。
しかし、デジタルワールドの発展と共に古くなった世界を消去し新しい世界を創るため、全てのデジモンを消去するという恐怖の「Xプログラム」が「イグドラシル」により発動された・・・!
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