『APPLESEED』

西暦2131年、世界を壊滅させた非核大戦が終結。

戦場をさまよう女兵士デュナンは未知の軍に遭遇し、巨大な都市へ連行される。

オリュンポスと呼ばれるその都市は、荒廃した世界で唯一繁栄する人類最後の砦。

だが一見平和なその街の人口の大半は、遺伝子操作で感情を抑制されたクローン人間《バイオロイド》であり、都市を統制するのは《ガイア》と呼ばれる巨大コンピュータだった。

デュナンは特殊部隊ESWATにスカウトされるが……。